Во-первых, с временем возникновения организма. Если он возник давно, то строение клеток, в процессе эволюции, скорее всего, стало более совершенным. Во вторых, это зависит от того одноклеточный это организм или многоклеточный. В-третьих, строение клетки связано с приспособленостью организма.