1. Двустворчатые имеют наружную раковину состоящую из двух створок. головоногие имеют лишь незначительные остатки редуцированной раковины, (например так называемая стрелка у кальмаров)
2. Головоногие имеют хорошо развитые органы зрения и способны "видеть" картинку. Двустворчатые специализировнных органов зрения не имеют.
3. По способу питания. Головоогие - активные хищники. Двустворчатые - фильтраторы.