При взаємодії йоду з крохмалем утворюється з'єднання включення - клатрат.
Клатрат - комплексне з'єднання, в якому молекули однієї речовини проникають в кристалічну структуру молекули іншої речовини.
Тобто в розглянутому взаємодії молекули йоду включаються в структуру амілози і амілопектину - складових крохмалю.
Даний процес супроводжується зміною забарвлення йоду при взаємодії з амілози на синьо-фіолетовий.