Он примирил католиков и протестов, которые враждовали между собой. Сперва в 1593 году он, будучи протестантом, принял католицизм(поскольку большая часть населения франции были католиками). А потом для прекращения межконфессиональной вражды Генрих IV 13 апреля 1598 года подписал Нантский эдикт, даровавший свободу вероисповедания протестантам. Вскоре после этого Гугенотские войны закончились.