Мама напугала мальчика за то, что он сделал. Перед "то" ставится запитая?

Если ты имеешь в виду сложноподчинённое предложение, то да, ставится. Например: Если я выучу правило, то не придётся сомневаться в постановке запятой перед ТО.
В твоём случае да!