В природе двустворчатые моллюски принимают участие в процессах самоочищения водоемов. Например, одна беззубка за сутки может пропустить через мантийную полость до 20 л воды.
Из раковин ископаемых моллюсков образуется особый вид известняка — ракушечник, применяемый в строительстве. Используют двустворчатых моллюсков и как «руководящие ископаемые».