Система корней кукурузы является мощной, мочковатой, состоит из четырёх ярусов корней - зародышевых, эпикотильных, узловых и воздушных.Такое разнообразие можно объяснить желанием растения выжить в любых условиях.
Зародышевый корень - это часть зародыша растения, что развивается в корень. Когда зародышевый корень появляется из прорастающего семени, его кончик защищен корневым чехликом (калиптрой), который позволяет ему проникнуть сквозь семенную кожуру (тесту) и внедриться в почву. У большинства растений из зародышевого корня развивается вся корневая система.