В отличие от эукариотов, у прокариотов гены цельные, представлены единой нуклеотидной последовательностью и не расчленены на кодирующие участки – экзоны и некодирующие интроны. По этой причине у прокариотов отсутствует сплайсинг – процесс вырезания некодирующих интронов в молекуле информационной РНК. Исключением являются гены, кодирующие рибосомальные и транспортные РНК (р-РНК и т-РНК), у которых имеется зачаточный сплайсинг и вырезаются отдельные петли.