Кроссинго́вер (от англ. crossing over — пересечение) или перекрёст — процесс обмена участками гомологичных хромосом во время конъюгации в профазе I мейоза. Помимо мейотического, описан также митотический кроссинговер.
Хромосома разделяется на эти участки в определённых точках, одних и тех
же для одного вида, что может быть определением вида на генетическом
уровне, место расположения этих точек задаётся единственным геном.
Поскольку кроссинговер вносит возмущения в картину сцепленного наследования,
его удалось использовать для картирования «групп сцепления» (хромосом).
Возможность картирования была основана на предположении о том, что, чем
чаще наблюдается кроссинговер между двумя генами,
тем дальше друг от друга расположены эти гены в группе сцепления и тем
чаще будут наблюдаться отклонения от сцепленного наследования. Первые
карты хромосом были построены в 1913 г. для классического
экспериментального объекта плодовой мушки Drosophila melanogaster Альфредом Стёртевантом, учеником и сотрудником Томаса Ханта Моргана.