Заповедником называется территория, где сохраняется в естественном состоянии природный комплекс, полностью исключена из хозяйственной деятельности. В башкортостане есть три заповедника:Общая площадь только заповедников Башкортостана составляет 327,1 тыс. га. Это приблизительно 40% площадей всех особо охраняемых природных территорий. Наиболее благоприятные условия для охраны и научного изучения лесов Башкортостана созданы в государственных заповедниках республики. Эти заповедники имеют не только республиканское, но и общероссийское и даже мировое значение. Следует особо отметить, что наши заповедники географически расположены на стыке 2 частей света: Европы и Азии, и потому они имеют весьма интересные флористические и фаунистические комплексы. Кроме того, эти заповедники, особенно заповедные леса, имеют громадное водорегулирующее значение. Несмотря на то, что старейшему Башкирскому государственному заповеднику скоро исполнится 70 лет флора, фауна и природные комплексы этого и других заповедников изучены совершенно недостаточно. О заповедниках Республики Башкортостан написано очень мало, особенно в научной литературе и данные, приведенные ниже, несколько устраняют этот пробел.