Причина в том, что доминантность/рецессивность аллели вовсе не является
определяющим фактором ее распространенности в популяции. Главным
фактором является полезность/вредность фенотипических проявлений этой
аллели. Аллели с вредными фенотипическими проявлениями не имеют никаких
шансов на широкое распространие в популяции, будь они хоть доминантными,
хоть рецессивными.
Лишние пальцы (полидактилия) - это не
полезное, но и не очень вредное фенотипическое проявление. Его можно с
некоторой натяжкой отнести к нейтральным, хотя я бы сказал, что оно
все-таки несколько вредное: лишние пальцы слегка снижает шансы их
обладателя на продолжение рода, потому что отталкивают часть
представителей противоположного пола.
Аллели с нейтральными
фенотипическими проявлениями не бракуются и не предпочитаются
естественным отбором, поэтому у них нет причин для постепенного захвата
всей популяции. Это относится и к полидактилии. К тому же, есть
подозрение, что при встрече ДВУХ полидактильных аллелей нарушается
внутриутробное развитие плода, что приводит к выкидышу. Поэтому
полидактилия остается сравнительно редким явлением.