Пищеварительная система относительно одинакова, кроме того, что птицы имеют специализацию кишечника, а именно толстую и тонкую кишки, в отличии от пресмыкающихся.
Дыхательная система птиц включает в себя воздушные мешки, характерные только для этого класса и
Кровеносная система классов замкнутая, как и у всех хордовых животных. У пресмыкающихся, за исключением крокодилов, кровь смешана, имеют 3 камеры сердца и зачаток перегородки в желудочке. Это объясняет их хладнокровность. Птицы теплокровные, имеют четырехкамерное сердце.
Спинной мозг птиц распространяется и на их крылья, в отличии от пресмыкающихся, у которых он закован в позвоночнике.
Птицы имеют оперение и кожу, лишенную желез. Пресмыкающиеся имеют сухие роговые чешуйки.
Птицы обитают в наземно-воздушной среде, пресмыкающиеся также в грунтовом.
Птицы имеют киль в области груди, которая помогает им в полете.
Как правило, птицы относятся дружелюбно к людям, а рептилии могут напасть и даже легко убить человека, в частности крокодилы и змеи.
Выделительная система у обоих классов представлена почками которые находятся в задней части.