Для всех рептилий характерно внутреннее оплодотворение.Большинство откладывают яйца в грунт. Бывает так называемое яйцеживорождение, когда яйца задерживаются в половых путях самки, и при выходе из них сразу вылупляются детеныши. У морских змей наблюдается настоящее живорождение, при этом у зародышей формируется плацента, сходная с плацентой млекопитающих.Развитие прямое, появляется молодое животное, сходное по строению со взрослым (но с недоразвитой половой системой). Это связано с наличием большого запаса питательных веществ в желтке яйцеклетки.В яйце пресмыкающихся формируются две эмбриональные оболочки, которых нет в икринках земноводных. Забота о потомстве у рептилий редка, заключается в основном в охране кладки.