Реимущество в том что покрытосемяные могут образовывать цветы, плоды и семенаВо-первых, как общий факт, у Голосеменных оплодотворение от начальной до последней стадии (появление семени) проходит в течение нескольких лет, когда, при помощи цветка, этот процесс стал умещаться в год.
Во-вторых, процесс опыления стал более эффективен (взять тот же запах и цвет цветка, который привлекает насекомых) , благодаря этому у Цветковых (те же Покрытосеменные) значительно больше представителей, нежели у Голосеменных.
В-третьих, благодаря цветку у Покрытосеменных появился плод (что так же способствует распространению семян) .
В-четвёртых, тут само название отдела говорит само за себя: семя стало покрыто защитной оболочкой, которая очень крепкая (попробуйте раскусить семя яблока) , когда семя голосеменных не защищено (хотя у рода Тис семя покрыто мясистой структурой).