Наш сторож Антип был бледен и(союз) долго не мог объяснить,в чём(союзное слово) причина его расстройства.
Само предложение сложноподчинённое,главное предложение:Наш сторож Антип был бледен и долго не мог объяснить...
Придаточное предложение:В чём причина его расстройства.
Главное и придаточное предложение соединены союзным словом (в чём?)
Был бледен и не мог объяснить-однородные сказуемые в главном предложении.