Среди редких видов травянистых растений здесь встречаются: лилия саранка, ландыш майский, дремлик широколистный и ветреница дубравная. Лунник оживающий, подлесник европейский также являются немногочисленными видами растений Москвы.
Алтуфьевский и Усадебные парки также играют важную роль в озеленении города. Из древесных видов здесь встречаются: липы, дубы, канадские тополя. Также можно увидеть американские клены и пансильванские ясени. Около водоемов возрастают ракиты и березы.