В конце 1846 года под натиском царских войск, спасаясь бегством из земель Среднего жуза, Кенесары перешёл на территорию Старшего жуза вблизи границ киргизских племён. Лишённый значительной социальной опоры на новых землях, решил улучшить своё положение завоевательными походами в Киргизию, которые вызвали жесткий отпор киргизов. В 1847 году у озера Иссык-Куль был захвачен в плен и казнён сарбазами киргизского манапа Калыгула.