1. Хламидомонада подвижна, имеет светочувствительный глазок, имеет 2 жгутика. Хлорелла неподвижна, светочувствительного глазка у жгутиков нет.
2. К порядку Вольвоксовые относится хламидомонада, а к порядку Хлорелловые.
Различия:
1) Хламидомонада относится к порядку Вольвоксовые, а хлорелла - к порядку Протококковые
2) Хламидомонада подвижна и имеет 2 жгутика и светочувствительный глазок; хлорелла неподвижна, жгутиков и светочувствительного глазка не имеет
3) Хламидомонада, в отличие от хлореллы, имеет сократительную вакуоль
4) Споры у хламидомонады также имеют жгутики и называются зооспорами; безжгутиковые споры хлореллы называются автоспорами
5) В неблагоприятных условиях хламидомонада размножается половым путём - с помощью гамет; у хлореллы полового процесса нет.