Пищеварительный тракт рыб состоит из ротовой полости, глотки и пищевода, желудка и кишечника. Кишечник, в свою очередь, состоит из нескольких отделов: тонкого и толстого, прямой кишки и клоаки (у некоторых видов), в которую выходят протоки половой и мочевой системы. Заканчивается пищеварительная система анальным отверстием.