Существительное вредитель (начальная форма) образовано от глагола "вредить", а тот в свою очередь от существительного "вред". Вот посмотрим словообразовательную цепочку, в которой ясно отображаются словообразовательные морфемы:
вред - вред-и-ть - вреди-тель.
Теперь не составит труда выполнить морфемный разбор существительного "вредитель":
ь- словоизменительная морфема, нулевое окончание (вредител-я, вредител-ем);
-тел- суффикс существительного, имеющего в данном случае значение "лицо, занимающееся какой-либо деятельностью", сравните: учи-тель, строи-тель, спаса-тель;
-и- суффикс глагола;
вред - корень слова (вредный, вредность, повредить, повреждение).
В результате наших исследований вот как выглядит морфемный состав существительного "вредитель":
вред-и-тель
корень/суффикс/суффикс/нулевое окончание.