Воротничковые жгутиконосцы (иначе называемые хоанофлагеллидами) имеют следующие три типа питания: автотрофный (самостоятельный синтез питательных веществ при задействовании квантов тепловой энергии), гетеротрофный (питание уже готовыми органическими веществами, пригодными для усваивания) и автогетеротрофное, или миксотрофное, питание - тип поглощения питательных веществ тем или иным способом в зависимости от условий.