У простейших организмов клетка выполняет функции всего организма, тогда как у многоклеточных такое невозможно.
Простейшие появились первыми и уже из них эволюционировали многоклеточные.
У простейших, в отличие от многоклеточных организмов имеются органоиды движения.
Деление клетки у простейших ведет к увеличению их популяции, в то время как деление клеток у многоклеточных ведет к росту тканей.
Многоклеточные организмы более устойчивы к различным воздействиям внешней среды.