Вообще-то, сперва у плоских червей появляется специализированная система выделения, которая представляет собой тонкие извилистые трубочки или канальцы - протонефридии
А сами нефридии появились уже у кольчатых червей
Если говорить о парных почках, то они появились только у позвоночных (начиная с рыб)