1) Нарушение круговорота веществ , т.к. бактерии замыкают трофические цепи , являются редуцентами .
Как хемосинтетики они также выполняют важные функции в круговороте веществ ( например : окислительно-восстановительная , которая заключается в изменении степени окисления многих химических элементов , перевод их в другие соединения и др.)
2) Снижение интенсивности процессов жизнедеятельности многих живых организмов , т.к. бактерии являются симбионтами и вступают в симбиоз с растениями , животными ( включая человека) , грибами и нек.др.
3) Нарушение в формировании среды обитания живых организмов ( бактерии участвуют в образовании почвы , горных пород , в регулировании газового состава атмосферы - хотя , незначительно )