Отряд рукокрылых делится на два хорошо обособленных подотряда:
1. Крыланы (Megachiroptera) - плодоядные формы от мелкого до сравнительно крупного (размах крыльев до 1.5 м) размера, с примитивными чертами организации. Распространены в тропиках и субтропиках только восточного полушария. крыланов
2. Летучие мыши (Microchiroptera) - животные небольшого размера. В основной массе насекомоядные, реже плодоядные, хищные и кровососущие формы с более специализированной организацией. Ареал подотряда совпадает с ареалом всего отряда.
В Европе встречаются представители только этого подотряда