Острой проблемой стало засорение Азовского моря пресноводными стоками, содержащими сельскохозяйственные удобрения, ядохимикаты выносимыми реками, особенно Кубанью, долина которой является районом интенсивного сельскохозяйственного использования, в том числе рисосеяния. Широко развитая тут водная мелиорация способствует тому, что с полей в реку смываются, а затем выносятся в море различные минеральные удобрения, губительно влияющие на его живые ресурсы.
Среди проблем Азовского моря первостепенное место занимают вопросы о том, как предотвратить повышение солёности и восстановить рыбопродуктивность. Будучи очень богатым на биомассу (от 100 до 200 грамм на куб. м) , оно до недавнего времени занимало одно из первых мест среди морей по рыбным запасам. Нерегулируемое уменьшение и загрязнение пресноводного стока, бесконтрольный лов привели к резкому их уменьшению.
Есть проблемы и у самого большого залива Азовского моря - залива Сиваш. Сиваш представляет собой мелководную и самую солёную часть Азовского моря (средняя солёность достигает 60 промилле) , с которым соединён Геническим проливом. Берега мелкие, топкие, летом пересыхают и покрываются солёным слоем.
Вот както так