Нигер занимает третье место среди других рек Африки по длине, площади бассейна и объему годового стока. На пути от истоков до устья на побережье Гвинейского залива он описывает дугу, вершина которой почти достигает Сахары. Современная река образовалась путем перехвата Пра-Нигера более молодыми реками, текущими на юго-восток. Перехват произошел в районе Томбукту, в месте разветвления дельты древней реки, впадавшей в плейстоцене в "Сахарское море" на юге Западной Сахары.
Верховья и низовья Нигера лежат в субэкваториальных и экваториальных областях, в полосе обильных летних дождей, где происходит питание реки. Среднее течение реки подступает к Сахаре, и на этом отрезке река теряет очень много воды. Расходы реки в верхнем и нижнем течении начинают возрастать с июня и достигают пика в сентябре. В среднем течении паводковые воды широко разливаются и затопляют рукава и протоки древней, так называемой "внутренней" дельты, но часть паводка все же достигает нижнего течения, где с февраля по апрель расходы вновь увеличиваются. Нигер образует в устье огромную дельту, одну из самых крупных в мире.