Для природної екосистеми єдиним джерелом енергії є Сонце. У той же час штучні, крім сонячної енергії, отримують додаткову енергію, яку витратила людина на виробництво добрив, хімічних засобів проти бур'янів, шкідників і хвороб, на зрошення або осушення земель і т. д.Друга відмінність зводиться до того, що в штучних екосистемах різко знижена видова різноманітність живих організмів. На полях зазвичай культивують один або кілька видів рослин, що призводить до значного збідніння видового складу тварин, грибів, бактерій. Крім того, біологічна одноманітність сортів культурних рослин, що займають великі площі (іноді десятки тисяч гектарів), часто є основною причиною їхнього масового знищення спеціалізованими комахами (наприклад, колорадським жуком) або ураження збудниками хвороб .
Третя відмінність полягає в різному балансі поживних елементів. У природній екосистемі первинна продукція рослин (врожай) споживається в численних ланцюгах (мережах) харчування і знову повертається в систему біологічного кругообігу у вигляді вуглекислого газу, води й елементів мінерального живлення.(Штучні-водойми,сади,поле,акваріум.Природні-рослина,ліс,пустеля,море.)