Стоит начать с отличий полового размножения спирогир и хламидомонад. У хламидомонады образуются зиготы путём сливания половых клеток в пары. По истечению стадии покоя, зигота образует зооспоры после мейоза. Из зооспор вырастает взрослая особь. У спирогиры половое размножение - конъюгация. При конъюгации образуется зигота, как результат процесса слияния двух клеток разных спирогир. Но стадию покоя спирогиры переживают в виде зигоспоры. Весной после мейоза из зигоспоры получается четыре споры. Из четырёх одна прорастает в особь водоросли, а вот остальные погибают. Общим для таких разных половых процессов есть то, что и у спирогиры, и у хламидомонады все стадии гаплоидные, и только стадия зиготы (у спирогиры и стадия зигоспоры) – диплоидная.