Судоходными являются реки: Онега, Северная Двина, Вычегда, Вага, Емца и Мезень.
Речной фонд состоит из 4457 рек, общей площадью 116 033 км. В 274 реках, с общей протяженностью 21 974 км.
В природном хозяйстве Архангельской области особую роль играет Белое море, являющееся внутренним морем Северного Ледовитого океана. В Белое море выходят устья рек Северная Двина, Мезень, Онега, Вычегда и др.
Основное количество озер находится в Озерном Прионежье, занимающем территорию между верхним и средним течением реки Онега и юго-западной границей Архангельской области. Здесь находятся озера Лача, Кенозеро, Кожозеро, Ундозеро и др.