Из редких видов млекопитающих, занесённых в Красную книгу России, в Карелии обитает эндемик – ладожская кольчатая нерпа. Кроме этого, в связи с низкой численностью, в Красную книгу Республики Карелия занесены лесной северный олень, косуля, выдра, ласка, росомаха, заяц-русак и европейская норка.