Предложение: Допустимо сделать один список красным, а второй зеленым, или должно быть что-то одно? В первом случае запятая поставлена верно, перед сочинительным союзом "а". Во втором случае запятая тоже поставлена верно, так как в сложносочиненном предложении перед союзом или ставится запятая. Всё правильно.