Кажется, что золотой, но на самом деле серебряный.
Ставим запятую перед союзами ЧТО и НО.
На самом деле - это не вводная конструкция, запятыми не обособляем.
Допустима поставка тире (как интонационнный авторский знак): Кажется, что золотой, но на самом деле - серебряный.