Историческая информация о численности разноэтнического населения Ферганской долины в период Кокандского ханства очень скудна. Воспользуемся сведениями востоковеда А. Куна. По оценкам автора, опиравшегося на устную информацию кокандских чиновников, в 1870-е годы в Ферганской долине проживало 132 тыс. семей оседлого и 60 тыс. семей кочевого народа. Это дает 960 тыс. человек. Если учесть, что кочевники в 1870-е годы в основном состояли из кыргызов и немногочисленных кыпчаков, то можно примерно определить количество кыргызского населения юга Кыргызстана как 350-400 тыс. человек и столько же на севере.
О точной численности коренного населения Кыргызстана в колониальный период трудно вести речь, но все же приблизительные оценки можно дать. По подсчетам историков, основанным на разрозненных источниках, всего кыргызов было более 800 тыс. человек.
Этнический состав кыргызского населения в колониальный период существенно изменился в ходе переселенческого процесса (русских, украинцев и немцев с территории России, дунганов и уйгуров из Кашгарского оазиса). Первое русское поселение здесь было образовано в 1866 году около укрепления Токмак выходцами из сибирских губерний и европейской части России. А в 1867 году близ города Пишпек (Бишкек) возникло село Лебединовское, в котором обосновалось 40 человек. Переселенческое движение развивалось постепенно. В 70-е годы XIX века уже возник ряд сел вдоль военно-торговых дорог: из Таласской долины по Чуйскому тракту до Иссык-Кульской котловины. Устройство русских селений проводилось по строгому плану. С 80-х годов XIX века переселенческое движение получило более широкий характер. В начале 90-х годов XIX века в связи с постигшими европейскую часть России неурожаем и голодом в Туркестан хлынула небывалая волна переселенцев-самовольцев, после чего началось переселенческое освоение юга Кыргызстана. В 1893 году в Ошском уезде было образовано с. Покровское (современный Куршаб Узгенского района), состоявшее из 20 семей. В 1897 году основаны три поселка. В 1899 году возникло с. Благовещенское, которое положило начало колонизации Кугартской долины.