В последнее время зона арктических пустынь претерпевает глобальных изменений из-за антропогенного влияния. Это породило следующие экологические проблемы Арктики:
Таяние льдов. С каждым годом повышается температура, изменяется климат и сокращается территория ледников, поэтому природная зона арктических пустынь активно сокращается, что может привести к абсолютному ее исчезновению, вымиранию многих видов флоры и фауны
Загрязнение атмосферы. Воздушные массы Арктики загрязняются, что способствует выпадению кислотных дождей и появлению озоновых дыр