Почему 4H пишется АТОМ, а 5FeS пишется МОЛЕКУЛА

FeS это молекула, представляющая собой соединение двух атомов (железа и серы).

4H это всего лишь четыре атома водорода, которые между собой не связаны (не путать с веществом H2, там атомы водорода соединены при помощи ковалентной неполярной связи).