Приступая к переписыванию, писец возносил к Богу молитву о благополучном окончании предпринятого труда. Писали крупно и буквы ставили прямо. На каждой странице оставляли широкие "берега" во все стороны, тоесть поля. Заглавные буквы писались красными чернилами, киноварью; отсюда название красная строка. (происхождение)
Писать с красной строки - значит писать с небольшим отступом от края страницы. Начать писать с красной строки так же значит начать писать новый абзац.