Какой-либо чётко выраженной анатомической структуры, разделяющей подвздошную и тощую кишки, нет. Однако имеются чёткие различия между этими двумя отделами тонкой кишки: подвздошная имеет больший диаметр, стенка её толще, она богаче снабжена сосудами. Подвздошная кишка — гладкомышечный полый орган. В стенке подвздошной кишки располагаются два слоя мышечной ткани: внешний продольный и внутренний циркулярный.
Кислотность в подвздошной кишке нейтральная или слабощелочная и обычно находится в пределах 7—8 рН.
Подвздошная кишка вырабатывает нейротензин. Этот нейропептид относится к регуляторам пищевого и питьевого поведения (анорексигенные вещества)
Число ворсинок в тонкой кишке очень велико. В подвздошной кишке (18—31 ворсинка на 1 мм2). В подвздошной кишке ворсинки они несколько тоньше, но выше (до 0,5—1,5 мм).
Таким образом количество и размер ворсинок обеспечивают большую поверхность всасывания для молекул еды, а слои мышечной ткани - продвижение пищи.