Этот метод называется дифференцированное центрифугирование. Метод основан на том, что различные клеточные органеллы имеют разную плотность. Процесс проводят в ультрацентрифуге, которая очень быстро вращается. В центрифугу помещают тонко измельченные клетки и органеллы при вращении выпадают в осадок из раствора, располагаясь слоями в соответствии со своей плотностью. Затем эти слои разделяют и изучают.