Солёность морской воды у поверхности в северо-западной части моря составляет 28 промилле, в южной части — до 15 промилле, около устьев рек — менее 10 промилле. Сильное влияние на солёность поверхностных вод оказывают сток сибирских рек и таяние льда. С увеличением глубины солёность быстро увеличивается, достигая 33 промилле.