Класс костные рыбы — самый крупный среди позвоночных (насчитывает свыше 20 тыс. видов). Более 90% видов костных рыб относятся к надотряду костистых. При этом надо учитывать, что для всех остальных групп костных рыб характерны признаки, наблюдаемые и у хрящевых рыб. Это — сохранение хорды во взрослом состоянии, артериальный конус сердца, спиральный клапан кишечника и ряд других. Неверно было бы считать эти особенности нехарактерными для костных рыб вообще на том основании, что их нет у костистых.
Нервная система и органы чувств костных рыб, так же как и выделительная система, принципиально сходны с хрящевыми рыбами.