У Плауна булавовидного спороносные колоски цилиндрические (2-4 см длиной), собраны обычно по два, реже по три-четыре, на длинных ножках, на которых редко размещены тонкие листочки с зубчатыми краями. Спорангии в колосках размещены в пазухах округлояйцевидних или треугольно-яйцевидных споролисткив.