Река вытекает из Исетского озера в 25 км к северо-западу от Екатеринбурга. Иногда к истокам Исети причисляют впадающую в Исетское озеро реку Шитовский Исток или даже впадающую в Шитовское озеро речку Бобровку.Ниже по течению реку питают 2 канала, проложенные из Волчихинского водохранилища. В этом месте планировалось судоходным каналом соединить бассейны Волги и Оби создав Трансуральский водный путьт через озеро Мелкое и в районе посёлка Палкино впадает в Верх-Исетский пруд Нижне-Исетский