В Иркутской области ислам исповедуют около 6% верующих жителей. В Иркутске действует Централизованная религиозная организация мусульман "Байкальский муфтият”, зарегистрированная в 2000 В 2007 между Байкальским муфтиятом и Центральным духовным управлением мусульман в России (Уфа) был заключён договор о сотрудничестве, в планах руководства муфтията вхождение в ЦДУМ. Кроме того поддерживаются отношения с Советом муфтиев России (Москва).
Имам-хатыб (настоятель) Иркутской соборной мечети – Фарит Мингалиев. Уже в зрелом возрасте, имея высшее образование, он решил изменить свою судьбу, посвятить себя служению Аллаху. Он сделал хадж в Мекку, посетил некоторые мусульманские страны.
В настоящее время в Прибайкалье действует четыре мечети – Соборная мечеть в Иркутске, Усолье-Сибирском,Черемхове и Тайшете. В 2011 началось строительство мечети для осужденных в исправительном учреждении №27. Мечеть будет возведена на пожертвования верующих мусульман области и станет первым молитвенным зданием для осужденных мусульман Приангарья.
Мусульманские общины зарегистрированы также в Ангарске,Братске, Усть-Илимске и п. Залари. Значительные группы мусульман имеются в Кутулике, Шелехово, Братске, Бохане, Осе, Нижнеудинске, Тулуне, Чуне и др. Как и прежде, компактно мусульмане проживают в национальных татарских селах и деревнях: Шаховское, Черемшанка, Сенная Падь (Заларинский р-н), Осипово Чунского района и др.
Большинство прибайкальских мусульман придерживаются суннитского направления в исламе, который представлен на 95% ханафитским мазхабом (это характерно и для России в целом). Часть дагестанцев, чеченцев и ингушей – шафииты. Среди верующих азербайджанцев и таджиков встречаются представители шиизма — второго по значимости после суннизма направления в исламе. Часть таджиков, выходцев из Горного Бадахшана, принадлежат к шиитской группе исмаилитов.
Всего в Иркутской области постоянно проживают около 25 тысяч мусульман, из них около шести тысяч – в Иркутске.