Музей Ильменского заповедника был создан при непосредственном участии его первого директора Д. М. Руденко (1883-1970). Новое здание этого музея было построено 1984 году. Участие в декоративно-отделочных работах принимали миасские мастера резьбы по камню, а также художники-оформители из Санкт-Петербурга.