Осенью 1236 года всё монгольское войско было разделено на четыре части, три из которых готовились к вторжению на Русь. После поражения войск Рязанского княжества монголы взяли Рязань 21 декабря 1237 года, после битвы у Коломны с соединёнными силами Северо-Восточной Руси в первых числах января 1238 года, в котором погиб сын Чингисхана Кюльхан, пала Коломна. Затем арьергард монгольского войска испытал на себе удар вернувшегося из Чернигова Евпатия Коловрата. Наиболее упорное сопротивление монголам оказали Москва (взята 20 января), Владимир (7 февраля), Переславль-Залесский, Тверь, Торжок (5 марта), Козельск (начало мая 1238 года). В начале марта 1238 года корпус монголов под командованием одного из крупнейших их полководцев Бурундая благодаря фактору внезапности смог уничтожить на стоянке соединённое русское войско и убить великого князя Юрия Всеволодовича Владимирского в битве на Сити. После долгой осады и взятия Торжка, монголы не стали идти на Великий Новгород и вернулись обратно, разоряя черниговские и смоленские земли. Весной 1238 г., после взятия Козельска, монголы отошли в южнорусские степи для откорма коней и перегруппировки.
Поскольку главные противники монголов к востоку от Днепра уже были нейтрализованы, Батый принял решение разделить свои войска на несколько корпусов, каждый из которых, действуя самостоятельно, решал локальные задачи по ликвидации оставшихся очагов сопротивления. Возможно, именно летом 1238 года (а не летом 1237 года) произошло подавление Мунке и Бучеком половецкого восстания и победа над аланами.
В конце 1238 года войска Мунке, Кадана, Гуюка и Бури развернули наступление на город Минкас (М.к.с., Микес[38]). Летом 1238 г. Шибан, Бучек и Бури предприняли поход в Крым, где: «у племени чинчакан (кипчаков?) захватили Таткару»[39]. Летом того же 1238 г. действовавший самостоятельно брат Батыя Берке взял в плен трёх половецких военачальников.
С наступлением 1239 г. источники фиксируют возвращение интереса монголов к лесостепному региону, где они последовательно наносят ряд сильных ударов на всём протяжении от Днепра до Волги. 3 марта 1239 года монголы штурмом взяли Переяславль-Южный («Переяславль Рускый») — владение владимирских князей в Южной Руси. Соборная церковь св. Михаила была разрушена, а епископ Симеон — убит.
Осенью 1239 года монголы (возможно[40][41], под руководством Мунке) нанесли удар по Черниговскому княжеству. Не надеясь на свои силы Михаил Всеволодович бежал сначала в Венгрию, пытаясь сосватать дочь венгерского короля Белы IV Анну за своего сына Ростислава (неудачно), а затем в Польшу к Конраду Мазовецкому. Оттуда, примирившись с Даниилом Галицким, он уже в 1240 г. вернулся на Русь и остановился в Луцке.
Не позднее 18 октября 1239 года был взят Чернигов. Во время осады на помощь городу пыталось пробиться войско во главе с двоюродным братом Михаила Всеволодовича, рыльским князем Мстиславом Глебовичем, но потерпело поражение. Были разграблены и разорены земли и города вдоль Десны и Сейма, в том числе Путивль, Глухов, Вырь и Рыльск[35]. По данным археологии, был сожжён и Гомель[42].
Зимой 1239—1240 гг. согласно Лаврентьевской летописи состоялся новый поход в Волго-Окский регион. Целью на этом этапе, вероятно, стали земли эрзи, чей князь отказался покориться монголам ещё в 1236 г.