Родственное (инбридинг)скрещивание это концентрация идентичных по происхождению аллелей генов в составе одного генотипа у конкретного организма или целенаправленное скрещивание близкородственных форм растений и животных с целью накопления в генотипе определённых аллелей гена, несущих нужный признак. В условиях инбридинга возможно погашение вредных генов переводом их в гетерозиготное состояние. Примеры. Выращивались тюльпаны нестандартных расцветок. Среди животных особенно часто подвергались инбридингу собаки это позволяло получать сильных, выносливых.
Неродственное (аутбридинг) это простой и надёжный метод разведения для получения стабильных по продуктивности потомков при отсутствии рекомбинантных потерь из-за потерь в уровне продуктивности. Аутбридинг наиболее часто применяемый метод разведения у всех видов животных и во всех породах. Его применение было предпосылкой для создания современных пород сельскохозяйственных животных. Примеры. При скрещивании двух мясных пород кур можно получить гетерозисных бройлерных кур, которые отличаются быстрым ростом и большой массой.
Внутрипородное скрещивание направлено на сохранение и улучшение породы. Характеризуется отбором лучших производителей и выбраковкой особей, не отвечающих требованиям породы. В племенных хозяйствах ведутся племенные книги, отражающие родословную, экстерьер и продуктивность животных многих поколений. Примеры. В свиноводстве используется внутрипородное разведение для получения кроссов, в птицеводстве внутрипородное скрещивание является основным методом разведения.
Отдалённая гибридизация это создание видов, сочетающих признаки и свойства разных видов и родов. Примеры межвидовой гибридизации: скрещивание мягкой пшеницы с твёрдой, подсолнечника с топинамбуром, овса посевного с овсом византийским. Скрещивание пшеницы с рожью, пшеницы с пыреем относятся к отдалённой гибридизации.