Южный Алтай расположен между реками Бухтарма, Черный Иртыш и озером Зайсан. На востоке сливается с плоскогорьем Урок. Отсюда отходят две цепи горных хребтов:
1) в северной части - Тарбагатай (2739 м) Сарымсакты (3373 м) и Нарым (2400 м).
2) на южной части - Южно-Алтайский (3483 м) и Курчумский (2644 м), хребты Сарытау (3300 м) и Азутау.