1) У плаунов в жизненном цикле преобладает спорофит, что повышает организацию. И вероятность оплодотворения. У мхов преобладал гаметофит.
2) Развивается корневище, что способствует лучшему поглощению воды и минеральных солей, это обеспечивается большей площадью и более сложным строение. Неорганические вещества нужны для жизненно важных процессов- питания. Допустим, вода является исходным продуктом фотосинтеза. А минеральные соли поддерживают постоянство внутренней среды, давление. Вообще, у них появилось корневище вместо ризоидов (выростов клеток), как это было у мхов.
3) Усложнилось строение тканей, развилась проводящая система, что обеспечило поднятие воды и минеральных солей к листьям, и отток органики от них.