Слово Тысяча оказывается числительным.
Ударение в нем падает на первый слог: тЫсяча.
Корнем слова оказывается морфема ТЫСЯЧ: Тысяча-Тысчонка-Тысячный.
Замечаем, что в корне этого слова имеется безударная гласная Я, а возможной ошибкой написания слова будет: тысЕча.
Проверить эту гласную с помощью однокоренных слов не получается, ударение на гласную Я нигде не падает и потому слово просто запоминаем.